Koduhovna praksa zen budizma je začela na Japonskem, v 6. stoletju , japonski budistični menihi , ki temeljijo na njihovih potovanjih na Kitajsko , se je začela razvijati japonskih Zen vrtov. Kot starodavne kapitala Japonske , Kyoto videli številne zen vrtov , zgrajenih okoli mesta.
Saiho -ji in Kennin -ji
Ti starodavni japonski zen vrtov vključeno Saiho -ji , ki se imenuje tudi Koke - dera (Moss Temple) , ki je prva se je izoblikovala ob koncu 6. stoletja in je bil prenovljen leta 1339 . Kennin -ji , jenajstarejši Zen tempelj v Kjotu in ima Chouontei , "vrt zvok plima . "
Ryoan -ji
Dodatne navdih je prišel preko uvoz Stark kitajskih krajinskih slik iz 14. in 15. stoletja , ki pomagali Japonski menihi omejite vizijo Zen vrtu . Eden izmed najbolj znanih Zen vrtovih , je Ryoan -ji ,Temple mirnega Dragon , zgrajena v 15. stoletju in še danes stoji v Kjotu.
